[ defaults ] ;nbfunc comb-rule gen-pairs fudgeLJ fudgeQQ 1 2 yes 0.5 0.833333 [ atomtypes ] ; name mass charge ptype sigma epsilon ca 12.0100 -0.31366 A 3.399676e-01 3.598240e-01 ; 1.91 ha 1.0080 0.17506 A 2.599647e-01 6.276000e-02 ; 1.46 OO 16.0000 -0.1200 A 2.896089e-01 1.058881299 O3 16.0000 0.2400 A 2.896089e-01 1.058881299 ; SPCE water OW 16.0000 -0.8476 A 0.3166224 0.6501936 HW 1.0000 0.4238 A 0.00000E+00 0.00000E+00 ; SPC/E water (for use with GROMACS general.itp) ; [ moleculetype ] ; molname nrexcl SOL 1 [ atoms ] ; nr type resnr residue atom cgnr charge mass 1 OW 1 SOL OW 1 -0.8476 2 HW 1 SOL HW1 1 0.4238 3 HW 1 SOL HW2 1 0.4238 [ settles ] ; OW funct doh dhh 1 1 0.1 0.16333 [ exclusions ] 1 2 3 2 1 3 3 1 2 [ moleculetype ] ; name nrexcl nap 8 [ atoms ] ; nr type resnr residu atom cgnr charge mass 1 ca 1 nap C1 1 -0.3234 12.01000 2 ca 1 nap C2 2 0.2212 12.01000 3 ca 1 nap C3 3 -0.3234 12.01000 4 ca 1 nap C4 4 -0.1946 12.01000 5 ca 1 nap C5 5 -0.1946 12.01000 6 ca 1 nap C6 6 -0.3234 12.01000 7 ca 1 nap C7 7 0.2212 12.01000 8 ca 1 nap C8 8 -0.3234 12.01000 9 ca 1 nap C9 9 -0.1946 12.01000 10 ca 1 nap C10 10 -0.1946 12.01000 11 ha 1 nap H11 11 0.2037 1.00800 12 ha 1 nap H12 12 0.2037 1.00800 13 ha 1 nap H13 13 0.2037 1.00800 14 ha 1 nap H14 14 0.2037 1.00800 15 ha 1 nap H15 15 0.2037 1.00800 16 ha 1 nap H16 16 0.2037 1.00800 17 ha 1 nap H17 17 0.2037 1.00800 18 ha 1 nap H18 18 0.2037 1.00800 [ bonds ] ; ai aj funct b0 kb 1 2 1 0.13870 400325. ;C1 -C2 1 10 1 0.13870 400325. ;C1 -C10 2 3 1 0.13870 400325. ;C2 -C3 2 7 1 0.13870 400325. ;C2 -C7 3 4 1 0.13870 400325. ;C3 -C4 4 5 1 0.13870 400325. ;C4 -C5 5 6 1 0.13870 400325. ;C5 -C6 6 7 1 0.13870 400325. ;C6 -C7 7 8 1 0.13870 400325. ;C7 -C8 8 9 1 0.13870 400325. ;C8 -C9 9 10 1 0.13870 400325. ;C9 -C10 1 11 1 0.10870 288110. ;C1 -H11 3 12 1 0.10870 288110. ;C3 -H12 4 13 1 0.10870 288110. ;C4 -H13 5 14 1 0.10870 288110. ;C5 -H14 6 15 1 0.10870 288110. ;C6 -H15 8 16 1 0.10870 288110. ;C8 -H16 9 17 1 0.10870 288110. ;C9 -H17 10 18 1 0.10870 288110. ;C10 -H18 [ pairs ] 1 4 1 1 6 1 1 8 1 2 9 1 2 5 1 10 3 1 3 6 1 3 8 1 4 7 1 5 8 1 6 9 1 7 10 1 1 12 1 1 17 1 2 18 1 2 13 1 2 15 1 2 16 1 11 3 1 3 14 1 4 15 1 5 12 1 6 13 1 6 16 1 7 14 1 7 17 1 11 7 1 7 12 1 8 15 1 8 18 1 11 9 1 10 16 1 11 18 1 12 13 1 13 14 1 14 15 1 16 17 1 17 18 1 [ angles ] ; ai aj ak funct th0 cth 1 2 3 1 119.970 562.3296 ;C1 -C2 -C3 1 2 7 1 119.970 562.3296 ;C1 -C2 -C7 1 10 9 1 119.970 562.3296 ;C1 -C10 -C9 2 1 10 1 119.970 562.3296 ;C2 -C1 -C10 2 3 4 1 119.970 562.3296 ;C2 -C3 -C4 2 7 6 1 119.970 562.3296 ;C2 -C7 -C6 2 7 8 1 119.970 562.3296 ;C2 -C7 -C8 3 2 7 1 119.970 562.3296 ;C3 -C2 -C7 3 4 5 1 119.970 562.3296 ;C3 -C4 -C5 4 5 6 1 119.970 562.3296 ;C4 -C5 -C6 5 6 7 1 119.970 562.3296 ;C5 -C6 -C7 6 7 8 1 119.970 562.3296 ;C6 -C7 -C8 7 8 9 1 119.970 562.3296 ;C7 -C8 -C9 8 9 10 1 119.970 562.3296 ;C8 -C9 -C10 1 10 18 1 120.010 405.8480 ;C1 -C10 -H18 2 1 11 1 120.010 405.8480 ;C2 -C1 -H11 2 3 12 1 120.010 405.8480 ;C2 -C3 -H12 3 4 13 1 120.010 405.8480 ;C3 -C4 -H13 4 3 12 1 120.010 405.8480 ;C4 -C3 -H12 4 5 14 1 120.010 405.8480 ;C4 -C5 -H14 5 4 13 1 120.010 405.8480 ;C5 -C4 -H13 5 6 15 1 120.010 405.8480 ;C5 -C6 -H15 6 5 14 1 120.010 405.8480 ;C6 -C5 -H14 7 6 15 1 120.010 405.8480 ;C7 -C6 -H15 7 8 16 1 120.010 405.8480 ;C7 -C8 -H16 8 9 17 1 120.010 405.8480 ;C8 -C9 -H17 9 8 16 1 120.010 405.8480 ;C9 -C8 -H16 9 10 18 1 120.010 405.8480 ;C9 -C10 -H18 10 9 17 1 120.010 405.8480 ;C10 -C9 -H17 10 1 11 1 120.010 405.8480 ;C10 -C1 -H11 [ dihedrals ] ; ai aj ak al funct phi0 cp mult 1 2 3 4 1 180.000 15.167 2 ; C1 -C2 -C3 -C4 1 2 7 6 1 180.000 15.167 2 ; C1 -C2 -C7 -C6 1 2 7 8 1 180.000 15.167 2 ; C1 -C2 -C7 -C8 1 10 9 8 1 180.000 15.167 2 ;eg C1 -C10 -C9 -C8 2 1 10 9 1 180.000 15.167 2 ; C2 -C1 -C10 -C9 2 3 4 5 1 180.000 15.167 2 ; C2 -C3 -C4 -C5 2 7 6 5 1 180.000 15.167 2 ;eg C2 -C7 -C6 -C5 2 7 8 9 1 180.000 15.167 2 ;eg C2 -C7 -C8 -C9 10 1 2 3 1 180.000 15.167 2 ; C10 -C1 -C2 -C3 3 2 7 6 1 180.000 15.167 2 ; C3 -C2 -C7 -C6 3 2 7 8 1 180.000 15.167 2 ; C3 -C2 -C7 -C8 3 4 5 6 1 180.000 15.167 2 ;eg C3 -C4 -C5 -C6 4 3 2 7 1 180.000 15.167 2 ; C4 -C3 -C2 -C7 4 5 6 7 1 180.000 15.167 2 ;eg C4 -C5 -C6 -C7 5 6 7 8 1 180.000 15.167 2 ; C5 -C6 -C7 -C8 6 7 8 9 1 180.000 15.167 2 ; C6 -C7 -C8 -C9 7 8 9 10 1 180.000 15.167 2 ; C7 -C8 -C9 -C10 10 1 2 7 1 180.000 15.167 2 ;eg C10 -C1 -C2 -C7 1 2 3 12 1 180.000 15.167 2 ; C1 -C2 -C3 -H12 1 10 9 17 1 180.000 15.167 2 ; C1 -C10 -C9 -H17 2 1 10 18 1 180.000 15.167 2 ; C2 -C1 -C10 -H18 2 3 4 13 1 180.000 15.167 2 ; C2 -C3 -C4 -H13 2 7 6 15 1 180.000 15.167 2 ; C2 -C7 -C6 -H15 2 7 8 16 1 180.000 15.167 2 ; C2 -C7 -C8 -H16 11 1 2 3 1 180.000 15.167 2 ; H11 -C1 -C2 -C3 3 4 5 14 1 180.000 15.167 2 ; C3 -C4 -C5 -H14 4 5 6 15 1 180.000 15.167 2 ; C4 -C5 -C6 -H15 5 4 3 12 1 180.000 15.167 2 ; C5 -C4 -C3 -H12 6 5 4 13 1 180.000 15.167 2 ; C6 -C5 -C4 -H13 6 7 8 16 1 180.000 15.167 2 ; C6 -C7 -C8 -H16 7 6 5 14 1 180.000 15.167 2 ; C7 -C6 -C5 -H14 7 8 9 17 1 180.000 15.167 2 ; C7 -C8 -C9 -H17 11 1 2 7 1 180.000 15.167 2 ; H11 -C1 -C2 -C7 7 2 3 12 1 180.000 15.167 2 ; C7 -C2 -C3 -H12 8 7 6 15 1 180.000 15.167 2 ; C8 -C7 -C6 -H15 8 9 10 18 1 180.000 15.167 2 ; C8 -C9 -C10 -H18 11 1 10 9 1 180.000 15.167 2 ; H11 -C1 -C10 -C9 10 9 8 16 1 180.000 15.167 2 ; C10 -C9 -C8 -H16 11 1 10 18 1 180.000 15.167 2 ; H11 -C1 -C10 -H18 12 3 4 13 1 180.000 15.167 2 ; H12 -C3 -C4 -H13 13 4 5 14 1 180.000 15.167 2 ; H13 -C4 -C5 -H14 14 5 6 15 1 180.000 15.167 2 ; H14 -C5 -C6 -H15 16 8 9 17 1 180.000 15.167 2 ; H16 -C8 -C9 -H17 17 9 10 18 1 180.000 15.167 2 ; H17 -C9 -C10 -H18 [ moleculetype] ; name nrexcl O3 1 [ atoms ] ; nr type resnr residue atom cgnr charge mass 1 OO 1 O3 OO1 1 -0.1200 16.0000 OO 2 OO 1 O3 OO2 1 -0.1200 16.0000 OO 3 O3 1 O3 O3 1 0.2400 16.0000 O3 [ bonds ] ; ai aj funct b0 kb 3 1 1 0.128 3539.0 3 2 1 0.128 3539.0 1 2 1 0.218 3539.0 ;[ angles ] ; ai aj ak funct c0 c1 ; 3 1 2 1 116.00000 5.000000e+04 [ exclusions ] 1 2 3 2 1 3 3 1 2 [ system ] ; title from amber topology napthalene v SPCE [ molecules ] ; molecule name nr. SOL 809 nap 1